Ein Jahr ist seit die Verschmelzung vergangen, als sich alle 16 Welten vereinten und die Ninja verschwanden. Arin ist ein autodidaktischer Spinjitzu-Amateur und lebt mit seinem Erfinderfreund Sora in Crossroads, einer gemischten Gemeinschaft. Sie treten mit ihrem Mech in ein Rennen ein, das von einem jungen Drachen namens Riyu unterbrochen wird, der von Drachenjägern aus dem Imperium verfolgt wird. Sora schließt sich Riyu an und entdeckt verborgene Elementarkräfte. Arin und Sora werden von Lloyd, dem Grünen Ninja, gerettet.