Después de que el Sensei se encierra a sí mismo dentro de una esfera de protección, los Thunder Rangers viajan a la Montaña de Ninjas Perdidos que contiene la Gema de Almas Perdidas que los ayudará a destruir al Sensei. Los Ninja Storm Rangers los ayudan sin saber los planes de éstos. Cuando finalmente llegan a la cueva, se revela todo: Lothor es el único responsable de la muerte de los padres de Hunter y Blake. Los Thunder Rangers finalmente toman el camino correcto, haciendo equipo con los Wind Rangers para luchar contra Lothor.
