Une usine géante d'extraction de métaux lourds, se déplaçant le long des fonds marins du Pacifique et collectant des déchets toxiques, a soudainement été victime d'un incendie de compartiment, la laissant hors de contrôle et se dirigeant vers un gouffre sous-marin. Thunderbird 2 est envoyé avec Thunderbird 4 pour effectuer le sauvetage du seul membre d'équipage, Ned Tedford une fois de plus, et sécuriser les déchets toxiques qu'il transporte. Lady Penelope, quant à elle, enquête sur la société propriétaire de l'usine d'extraction, lorsque John et Gordon soupçonnent que le propriétaire était plus préoccupé par la cargaison que l'équipage, et a bientôt des problèmes avec le Hood.
