L'NCIS indaga sulla sparizione di una bambina da una base marine a Quantico. Il nonno della ragazza complica le indagini di Gibbs e i suoi uomini. Gli indizi riguardanti una scia di omicidi conducono proprio all'uomo, il quale confessa di aver fatto parte di una operazione condotta al di fuori della catena di comando. Qualcuno si sta servendo del rapimento della nipote allo scopo di farlo uscire dal suo ritiro e regolare così tutti i conti del passato. Gibbs organizza l'ennesimo bluff. Intanto, tre tirocinanti sono assegnati ai membri della squadra NCIS. Abby è preoccupata dal momento che l'ultimo tirocinante ha tentato di ucciderla. McGee ha a che fare con un giovane che non sembra essere interessato al lavoro sul campo, mentre Ducky sembra trovarsi a suo agio con la sua nuova allieva.
