L'ospedale è ancora in quarantena mentre il dottor Shaun Murphy continua ad essere sopraffatto dal caos e dal rumore del pronto soccorso; il dottor Morgan Reznick lotta per mantenere in vita i suoi pazienti, e la dottoressa Audrey Lim combatte per la sua vita. Nel frattempo, il dottor Neil Melendez e la dottoressa Claire Browne devono trovare un modo per completare il trapianto di midollo osseo del loro paziente, nonostante la quarantena.