Kiedy tajemniczy obcy organizm zabiera dr Jennifer Keller jako gospodarza, nowo odrodzony dr Carson Beckett i załoga desperacko poszukują surowicy, która uratuje ją przed ewoluującym intruzem, zanim zdąży przeniknąć do Atlantydy. W międzyczasie Richard Woolsey oficjalnie dołącza do zespołu, który został wybrany na zastępcę pułkownika Samanthy Carter, by poprowadził ekspedycję Atlantis.