Более короткая и обтекаемая версия Нади под названием «История Наутилуса», в которой практически исключена дополнительная арка и основное внимание уделяется борьбе между Немо и Горгульей. Некоторые сцены в наиболее важных эпизодах также вырезаны. Серия компиляций была сделана Хидэаки Анно, который, как говорят, был недоволен окончательным результатом телешоу. «История Наутилуса» была выпущена только в Японии на видеокассетах и лазерных дисках.