Ichabod Crane och Abbie Mills anpassar sig fortfarande till 2000-talet, medan de försöker bena ut de gäckande mysterierna i Sleepy Hollow. En skrämmande uppenbarelse av Ichabods före detta fru Katrina för den osannolika duon ut på jakt efter en hämndlysten häxa från 1700-talet, som väckts av okända onda krafter och orsakar förödelse i den pittoreska staden. Samtidigt är Andy Brooks mot alla odds tillbaka, i färd med ett tvivelaktigt uppdrag.