「假如我变成坏人的话,学长就不会原谅我了吧?」少年想要守护少女,仅此而已的故事。 魔术师〈MASTER〉和英灵〈SERVANT〉,围绕着能够实现所有愿望的许愿机「圣杯」而战斗——在「圣杯战争」发生的10年后,冬木市又一次掀起了战争。 前代「圣杯战争」的参加者卫宫切嗣的养子・卫宫士郎继承了遗志,终于下定决心参战。 士郎的身边,陪伴着仰慕他的少女——间桐樱。她每天早晨晚上都来到卫宫家,为他打扫房间和制作料理,孑然一身的她和士郎度过了平稳而又温情的日常。 但是随着战争的开始,冬木市街道上到处发生着杀人事件,险恶的空气开始流动。所以士郎决定让樱留宿在自己家里。 士郎召唤出从者・Saber的同时,和身为正统魔术师的远坂凛结盟面对「圣杯战争」。但是,这场战争由于某些人的暗中策划而发出不和谐音,开始变得扭曲了。