Alphonse est bouleversé à l’idée qu’il ne soit peut-être pas humain et cherche des réponses. Pendant ce temps, Lust, Envy et Glutony préparent un coup. Ed et Al découvrent que le laboratoireno 5, celui qui était autrefois utilisé pour les recherches de l’État sur la pierre philosophale, est anormalement protégé pour un bâtiment prétendument désaffecté. Ils vont y faire la connaissance de deux étranges personnages : les prisonniers no 48 et no 66.
