La Fédération s'allie aux Klingons et aux Romuliens, dans le but d'éliminer le Dominion. Benjamin Sisko est choisi pour mener à bien la mission. En son absence, Dax prend les commandes de la station. Pendant ce temps, sur Cardassia, Gul Skrain Dukat obtient un «Pah-wraith» lui permettant de détruire le «Trou de Vers» et les Prophètes...