La convivenza tra Sheldon ed Amy prosegue a fatica, in quanto il ragazzo vuole come al solito imporre le sue abitudini, ma la ragazza non vuole cedere; dopo aver passato del tempo il primo con Penny e la seconda con Leonard, il ragazzo cede e acconsente di condividere il contenitore degli spazzolini da denti con la ragazza. Nel frattempo, a causa delle continue nausee, Howard e Bernadette rinunciano alla loro vacanza a Palm Springs e decidono di nascondersi a casa per passare del tempo da soli; la loro serata però è turbata quando prima Stuart e poi Raj, convinti che i due sposini non ci siano, entrano nella loro casa per usare la vasca idromassaggio.