Cowen e Stinger , assieme al redivivo Dott. Saotome, tramano su come impossessarsi dello Shin Dragon. Mentre il gruppo si reca a far visita a Benkei, Saotome fa la sua spettacolare comparsa e rivendica la paternità di Kai, svelando che in realtà la ragazza è Genki, ossia colui che si credeva essere il figlio minore di Saotome. Benkei è costretto a confermare ciò che sostiene lo scienziato, causando un feroce rifiuto da parte di Kai, che si scaglia contro il genitore a bordo della Shin Getter Jaguar. Saotome, ormai completamente infettato dagli invasori che tempo fa aveva strenuamente combattuto, rigenera parti del proprio corpo distrutte dalla lotta con Kai. A complicare le cose arriva un enorme Metal Beast, un essere derivante dalla fusione tra un Invasore e un corpo meccanico...