Dopo aver riportato Goodra a casa, i nostri eroi si trovano davanti un orribile tentacolo gigante, simile a quelli scatenati dal Team Flare contro Luminopoli! Lo scienziato Xante sta cercando di portare avanti il piano di Elisio e arriva perfino a scagliare un raggio ipnotico su Lem! Ma il ragazzo è troppo astuto: una sua invenzione segreta lo salva, mentre Xante finisce in prigione. Quando un altro tentacolo attacca i nostri eroi, Mollicino corre in loro aiuto. con una richiesta impegnativa: il Greninja di Ash è capace di percepire l’energia negativa che nutre quelle radici e Mollicino ha bisogno del suo aiuto per fermarle.